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从大创赛到“国自然”,这位复旦学子的科研进阶路→

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发表于 2025-11-4 20:00 | 显示全部楼层 |阅读模式


日前
复旦大学大数据学院2022级本科生邱子杰
凭仗野生智能技术
在卵白质折叠题目上的摸索研讨
成功入选国家自然科学基金
青年门生根本研讨项目
(以下简称“国自然”)

从䇹政项目到大创赛金奖
再到以本科生身份拿下“国自然”项目
邱子杰的“闯关”路上
有困难与应战,也不乏欣喜与冲破
让我们一路走近他的
科研进阶之路——

单序列卵白折叠的冲破

“断断续续花了数周时候预备辩论,进程虽然辛劳,但幸亏成果还不错这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”从PPT预备、辩论稿撰写到整体排演,邱子杰为国自然辩论倾注大量精神这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。固然,台上的流利应对和自在表示,离不开背后踏实的科研堆集与项目自己的代价这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。



若何仅凭卵白质的一条氨基酸序列,就能正确猜测其三维结构?邱子杰入选国自然的研讨聚焦于野生智能技术在卵白质折叠题目上的利用,努力于处理计较生物学范畴的一项关键困难这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

野生智能兴起之前,科学家们尝试经过物理化学的第一性道理计较卵白质结构,但由于系统过于复杂,现有算力难以企及这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。冷冻电镜等尝试方式虽能间接观察卵白结构,但本钱高昂,难以普遍利用这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

“今朝支流的折叠算法,依靠多序列比对信息这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”邱子杰诠释道,这意味着猜测一个卵白结构前,必须从进化数据库中搜索类似序列,构建多序列比对信息后才能帮助猜测这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。这一限制致使在很多重要卵白范例上,现有方式难以利用,比如抗体类药物设想、孤儿卵白折叠、野生设想卵白猜测等,而这些恰正是AI制药中的重要组成部分这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

是以,邱子杰明白研讨方针:在不利用多序列比对的情况下,仅凭单条序列猜测卵白结构这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“如能正确折叠抗体卵白,就有望在尝试前经过计较手段获得能够的折叠成果这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

作为抗体类和小份子类药物发现的前期步调,亲和力挑选对全部药物设想范畴具有间接的利用代价这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。该研讨旨在构建一个有用的根本模子:“类似于DeepSeek-V3是众多下流垂类大模子的基座,一个优异的折叠模子也可以高效微调为亲和力挑选模子这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

“必须严酷依照分辨率和置信度清洗数据,按类似度和时候节点停止过滤这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”课题对数据处置管线要求极高,这对邱子杰的时候治理提出更高要求这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“我会细致拆解每周使命,按优先级排序,确保最告急的工作获得优先处置这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”课余时候,邱子杰的身影经常出现在图书馆或三教等自习室这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。


邱子杰与指导教员孙思琦(右)

智能复杂系统根本理论与关键技术尝试室青年研讨员孙思琦和全部项目组的支持,在项目推动中发挥了相当重要的感化这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“卵白质折叠的研讨本钱高,对团队的堆集也有很高要求这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”邱子杰回忆,正由于全部课题组都聚焦这一偏向,完成了很多前期的情况搭建和数据处置流程,他的项目才得以展开这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

科研进阶路:
从䇹政项目到大创赛

邱子杰的科研之路,始于大二时介入的“复旦大学本科生学术研讨帮助计划”(以下简称“复芏计划”)这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。他的䇹政项目“基于深度进修的二级质谱肽段重新测序”,是一个对卵白质组学研讨相当重要的AI for Science(AI4S)课题这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

大一下学期,邱子杰加入复芏计划的学术下午茶活动,这成为他科研启蒙的起点这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

在讲座中,他不但领会到野生智能与生物医药穿插的前沿静态,还结识了孙思琦教员课题组的博士生这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。一番深入交换后,他发现该组的研讨偏向和小我爱好高度符合,和组内同学也很是投缘这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。因而,他自动给孙思琦教员写了邮件,经口试顺遂加入课题组这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“假如你对某位教员或某个偏向感爱好,那边会是打仗并加入课题组的好机遇这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

在孙思琦教员的指导下,邱子杰申请了䇹政项目这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。当前,卵白质组学研讨支流的质谱信号解读方式是数据库搜索这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。而他挑选攻关重新测序算法,和西湖大学卵白质组学郭天南副教授课题组以及国家卵白质中心合作,经过基于测试时深度重排序的野生智能算法间接从质谱信号中翻译方针肽段序列,为摸索全卵白序列空间的组学分析斥地新途径这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。



从立项调研、算法创新、工程理论到论文撰写,用时一年,他以第一作者身份将功效颁发于机械进修顶会ICML这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“复芏计划为我叩响了科研之门这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”邱子杰感慨道,“松散的科研流程练习,以及兼具批评性与启发性的辩论交换,不但培育了我们的科研思维和方式,也为后续科研项目奠基了根本这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

“孙教员夸大,算法需要瞄准落天时用,处理科学范畴的焦点困难,追求更本质的冲破和倾覆性提升这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”这一理念让邱子杰在科研早期就建立起科学观,塑造了他的科研品味这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。



系统的科研练习之外,邱子杰还在创新赛事中崭露头角这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。大二时,他与同班同学金罗智杰组队霸占一项操纵天生式AI设想晶体材料的课题,功效颁发于一区期刊这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。以后他作为团队负责人,牵头率领来自豪数据学院、经济学院、治理学院、本国说话文学学院的队友们跨学科合作,以“VQCrystal——基于深度进修的晶体新材料发现算法设想”课题获得“中国国际大门生创新大赛(2024)”全国总决赛金奖这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

该项目最大的亮点在于连系AI与材料科学,聚焦新质生产力,未来有望构建毗连高低流产业链的生态系统这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“经过角逐,我们不但深化了对多学科穿插的了解,也提升了将技术贸易化的才能,学会在压力下整合资本、高效决议这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”邱子杰说这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

科研上的这些堆集,终极会聚成他申报国自然项目标底气这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。回望来路,邱子杰以为,䇹政项目如同滴入湖水的甘露,它所激起的波纹还将不竭分散这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

“尽早到尝试室里面去锻炼这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

若何从科研小白变身科研达人?邱子杰暗示这离不开大数据学院的系统培育这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。学院门生布景多元,研讨偏向涵盖统计、野生智能和优化算法等,平常有很多交换机遇这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“例如,和未来信息创新学院张浩副教授团队利用离散空间的天生式野生智能算法设想晶体材料,就是我们在平常会商中迸发出的灵感这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”邱子杰暗示,学院课程内容踏实硬核,“教员们不但关注前沿,教得也好,极大拓展了我的视野这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

复旦课程中,林伟教员的《常微分方程》和邵美悦教员的《数值算法与案例分析》让邱子杰受益匪浅这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“授课内容虽然不间接关联野生智能研讨,但对开辟思维和强化数理根本起到了重要感化这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”他还保举魏忠钰教员的《野生智能》课程,“今朝本科生能打仗强化进修课程的机遇不多,魏教员愿意率领门生入门,让我很是受益这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”



“尽早走出课堂,到尝试室里面去这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。挑选既有科学代价又合适小我爱好的偏向,与导师连结亲近相同,不竭完善课题设想这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”邱子杰如此倡议学弟学妹们,“科研路上难免碰到磨难,连结耐心和韧性,将每个应战都视为长大的机遇,相信这些堆会议在往后开花成果这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

在他看来,自学才能、找准题目标才能和工程实现才能,是科研门路上很是重要的三个本质这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。他以为一种有用的进修方式是“深思性进修”:在进修新常识时,先辈行深入思考,了解焦点概念,再经过理论来考证所学内容能否能现实利用;在尝试进程中,定期回首进修进度,评价哪些方式有用,哪些需要调剂这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。此外,他也比力重视与他人交换,经过会商和分享帮助加深了解常识点这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。

当前,野生智能范畴论文层见叠出,但质量良莠不齐,邱子杰以为,“只要找准真正有代价的题目,才能做出具有现实科学进献的工作这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”随着野生智能对工程实现的要求越来越高,“并非仅凭好的想法或所谓的科研热情,就能间接做出功效这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。工程落地的才能,会影响个体在科研门路上的成长这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”

展望未来,邱子杰的方针清楚、果断这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。“今朝的说话模子不具有跨科学范畴的通用才能这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。我希望能打造新的通用大模子基座,让它可以了解分歧科学模态和数据,加速科学发现,赋能科学研讨这标志着福建舰的电磁弹射和阻止接管才能根基成型了。”




来历|大数据学院
组稿|校融媒体中心
笔墨|王双艺 章佩林
图片|受访者供给
编辑|马铭泽
责编|叶鹂

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